84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4500 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  56.9 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  55.88 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  48.15 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  53.33 
 
 		 233 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  50.71 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  56.31 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  56.44 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  43.9 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  59.57 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  49.57 
 
 		 222 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  58.1 
 
 		 263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  50.46 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  47.79 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  39.16 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  58.1 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  50.47 
 
 		 301 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  51.69 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  49.53 
 
 		 286 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  53.04 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  54.72 
 
 		 286 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  52.88 
 
 		 235 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  49.09 
 
 		 293 aa  104  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  52.88 
 
 		 235 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  47.24 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  49.59 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  55.24 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  43.57 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  52.94 
 
 		 236 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  43.14 
 
 		 240 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 276 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  40.32 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  40.18 
 
 		 348 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  37.41 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  41.82 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  38.06 
 
 		 209 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  36.29 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  35.83 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  37.5 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  38.68 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  35.64 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  37.29 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  34.26 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  37.61 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  37.61 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  37.61 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  36.45 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  35.19 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  44.3 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  36.51 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  45.45 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  42.35 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  34.26 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  34.04 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  29.22 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  36.92 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  27.75 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  32.12 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  34.51 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  31.48 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  42 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  34.04 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2914  protein of unknown function DUF1003  29.41 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273377  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  30.97 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19380  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 256 aa  57.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259397  normal  0.0169508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  29.09 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  36.47 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  30.91 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  33.33 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2791  hypothetical protein  30.59 
 
 		 236 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0480171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2511  protein of unknown function DUF1003  29.41 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000601993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  28.69 
 
 		 262 aa  47.8  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  29.67 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  33.67 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  32.94 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3499  protein of unknown function DUF1003  26.67 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  30.21 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  26.13 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  26.13 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>