55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2088 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2088  protein of unknown function DUF1003  100 
 
 		 116 aa  235  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000793332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  56.79 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  37.72 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  45.78 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  37.04 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  35.65 
 
 		 217 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  36.13 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  35.65 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  37.5 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  38.46 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  35.65 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  35.96 
 
 		 301 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  42.16 
 
 		 196 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  38.1 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  36.44 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  35.51 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  31.78 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  30.83 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  40.48 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  39.53 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  33.91 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  34.95 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  33.98 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  52.08 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  32.26 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  35.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  36.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  41.98 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  26.4 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  37.7 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  30.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  29.41 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  36.07 
 
 		 348 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  36.07 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  41.94 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  28.24 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  28.24 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  28.24 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  32.79 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  30.61 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1157  protein of unknown function DUF1003  36.51 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.74918  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  32.26 
 
 		 175 aa  42  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  26.15 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  27.35 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  44.68 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  35.19 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>