60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1546 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  47.14 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  39.88 
 
 		 286 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  43.57 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  37.87 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  36.65 
 
 		 263 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  40.43 
 
 		 248 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  41.73 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  44.6 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  53.85 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  41.04 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  37.12 
 
 		 235 aa  95.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  48.42 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  46.88 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  33.09 
 
 		 293 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  45.26 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  35.11 
 
 		 246 aa  85.9  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  46.46 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  54.55 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  36.79 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  59.7 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  48.28 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  54.93 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  45.33 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  40.91 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  45.33 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  42 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  50 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  51.67 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  48.33 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  47.69 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  45 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  45.9 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  44.26 
 
 		 348 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  46.67 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  43.33 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  44.83 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  43.33 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  44.62 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  41.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  43.64 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  45.16 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  37.8 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  45.16 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  43.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1819  hypothetical protein  29.03 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.245633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  30.53 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  39.66 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>