More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0115 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0115  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  530  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  31.84 
 
 		 190 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  34.75 
 
 		 186 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  34.04 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  29.78 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  30.73 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  32.93 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  32.54 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  32.24 
 
 		 175 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  28.99 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  31.79 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  31.82 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  28.65 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  31.17 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  31.21 
 
 		 172 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  28.65 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  27.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  27.49 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  27.49 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  27.49 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  27.49 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  27.49 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  27.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  27.37 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  29.88 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  28.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  28.74 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  28.16 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  27.01 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  28.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  28.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  28.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  28.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  28.93 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  29.07 
 
 		 182 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  72  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0280  Shikimate kinase  29.7 
 
 		 180 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  31.03 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  27.59 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  29.8 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  32.75 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1639  shikimate kinase  30.13 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00313687  normal  0.0402231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4297  Shikimate kinase  31.45 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.911234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  30.46 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  26.11 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  28.48 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  28.07 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  28.9 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  31.13 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  30.77 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  31.94 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  29.24 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  29.87 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  29.93 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  28.08 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0723  shikimate kinase  30.57 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  31.33 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  26.38 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1850  shikimate kinase  31.79 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  28.97 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  30.06 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  26.32 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0971  shikimate kinase  30.14 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.488424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1973  shikimate kinase  28.26 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0334894  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  25.77 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  30.34 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  30.23 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  29.33 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2389  Shikimate kinase  30.82 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0912  shikimate kinase  29.75 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  30.43 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  26.42 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  25.61 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  26.92 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  30.34 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6534  Shikimate kinase  27.61 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  28.32 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  25.87 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  30.67 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  31.48 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  28.32 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1410  Shikimate kinase  28.48 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3880  shikimate kinase  27.71 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>