More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0348 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0348  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0326  hypothetical protein  97.21 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0808  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 294 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  33.68 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  33.45 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.02 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0835  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  32.29 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  31.31 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 301 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  32.3 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  33.56 
 
 		 315 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001199  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.862431  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04988  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1233  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.573429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.52 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4637  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.416318  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4131  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.19 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>