60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2720 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
648 aa  1212    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  48.82 
 
 
640 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  41.36 
 
 
627 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  33.22 
 
 
863 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 
822 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  34.38 
 
 
852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  28.3 
 
 
854 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
822 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.92 
 
 
807 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 
828 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
874 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  29.63 
 
 
838 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  28.39 
 
 
823 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.24 
 
 
841 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  32.18 
 
 
833 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.6 
 
 
821 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.32 
 
 
845 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 
853 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
848 aa  67.8  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.08 
 
 
847 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.39 
 
 
841 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
855 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 
856 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.52 
 
 
842 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.62 
 
 
843 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.57 
 
 
858 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
449 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27 
 
 
825 aa  57.4  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  32.09 
 
 
445 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 
834 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
878 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  46.88 
 
 
866 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 
873 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 
855 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 
930 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
638 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.06 
 
 
880 aa  51.6  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 
897 aa  50.8  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 
831 aa  50.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
861 aa  50.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  35.37 
 
 
838 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
852 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.43 
 
 
829 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  50.85 
 
 
846 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.43 
 
 
829 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  26.87 
 
 
829 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
806 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  47.83 
 
 
846 aa  48.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 
852 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  37.36 
 
 
867 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
459 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  39.71 
 
 
409 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  30.84 
 
 
865 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  46.94 
 
 
853 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  41.79 
 
 
857 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
441 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.05 
 
 
859 aa  44.3  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
859 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  21.28 
 
 
896 aa  43.9  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>