More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1560 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 331 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  67.92 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  62.03 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  61.13 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  62.26 
 
 		 317 aa  348  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  63.29 
 
 		 321 aa  348  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  65.08 
 
 		 313 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  65.29 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  60.55 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.3 
 
 		 318 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.3 
 
 		 318 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.3 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  59.09 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.49 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.51 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  60.56 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  60.84 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  60 
 
 		 308 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  58.64 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  58.2 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  62.89 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  58.73 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  59.38 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  60.13 
 
 		 310 aa  308  6.999999999999999e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  57.45 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  60.37 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  52.73 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  59.11 
 
 		 299 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  54.49 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  58.46 
 
 		 325 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  55.66 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  55.38 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  54.93 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  48.43 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  53.61 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  44.55 
 
 		 302 aa  255  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.74 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.06 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.14 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  44.14 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  38.29 
 
 		 295 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1758  integrase family protein  53.09 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488752  hitchhiker  0.0032662 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  45.57 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  40.51 
 
 		 296 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.97 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  39.75 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.43 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.12 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.8 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  45 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 295 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 295 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  43.81 
 
 		 295 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  42.32 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.41 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  39.75 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  39.94 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  39.06 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  42.95 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  43.49 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  45.91 
 
 		 302 aa  219  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  43.37 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  40.19 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  37.74 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  42.41 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 294 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  45.43 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  42.22 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  42.22 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  45.11 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  38.28 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  33.54 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.27 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  41.39 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  41.59 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>