More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1494 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  68.61 
 
 
635 aa  782    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  67 
 
 
616 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  57.69 
 
 
614 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  58.22 
 
 
600 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  100 
 
 
595 aa  1155    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  63.34 
 
 
593 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  55.92 
 
 
615 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  57.56 
 
 
590 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  57.31 
 
 
609 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
590 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  55.61 
 
 
602 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  56.12 
 
 
620 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.65 
 
 
618 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  53 
 
 
615 aa  587  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  55.2 
 
 
593 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  56.09 
 
 
609 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.52 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  56.67 
 
 
581 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  57.58 
 
 
588 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  54.56 
 
 
589 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.39 
 
 
984 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  37.02 
 
 
610 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  37.02 
 
 
610 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.02 
 
 
610 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.77 
 
 
636 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.68 
 
 
1257 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
606 aa  294  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.67 
 
 
1301 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  38.04 
 
 
605 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
614 aa  289  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.57 
 
 
567 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.39 
 
 
567 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.55 
 
 
567 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
1218 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.23 
 
 
572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  38.89 
 
 
1436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  38.16 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  38.36 
 
 
652 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  37.8 
 
 
582 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  36.48 
 
 
619 aa  281  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  37.8 
 
 
582 aa  281  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.94 
 
 
1522 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.23 
 
 
576 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
572 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.44 
 
 
617 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
1332 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.8 
 
 
584 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  37.76 
 
 
566 aa  273  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 
608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 
608 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.86 
 
 
610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  35.4 
 
 
568 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  36.3 
 
 
1321 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.28 
 
 
600 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
606 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.77 
 
 
598 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  35.3 
 
 
615 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.68 
 
 
597 aa  267  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.31 
 
 
609 aa  266  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  38.24 
 
 
582 aa  266  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.37 
 
 
566 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.67 
 
 
601 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.78 
 
 
572 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.89 
 
 
582 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.77 
 
 
594 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.54 
 
 
623 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 
566 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.78 
 
 
572 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  33.33 
 
 
619 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.78 
 
 
572 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  37.97 
 
 
565 aa  264  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.15 
 
 
577 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  31.36 
 
 
576 aa  262  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.52 
 
 
598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
598 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.52 
 
 
598 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.58 
 
 
598 aa  261  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
661 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  34.48 
 
 
619 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.82 
 
 
584 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.98 
 
 
588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
604 aa  260  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  30.93 
 
 
598 aa  260  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  30.31 
 
 
598 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 
598 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 
598 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
598 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
615 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  32.32 
 
 
601 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  30.72 
 
 
605 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.66 
 
 
614 aa  258  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  32.32 
 
 
601 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  30.71 
 
 
585 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
811 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  35.9 
 
 
634 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 
571 aa  257  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 
598 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.61 
 
 
571 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>