More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0101 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.41 
 
 		 268 aa  334  7e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  66.54 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  63.98 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  61.87 
 
 		 256 aa  324  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  63.78 
 
 		 254 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  62.6 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  64.2 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  66.27 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  64.5 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  63.6 
 
 		 263 aa  318  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  60.54 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  62.16 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  62.26 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  61.96 
 
 		 250 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  61.18 
 
 		 250 aa  314  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  60.92 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  62.75 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  61.18 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  58.04 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.69 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  61.69 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.53 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  60.15 
 
 		 274 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 254 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  61.78 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  60.46 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  60.24 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.6 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  61.26 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  58.59 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.47 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  60.31 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.24 
 
 		 597 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  59.58 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  57.25 
 
 		 254 aa  292  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  60.24 
 
 		 597 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.24 
 
 		 597 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  59.14 
 
 		 267 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  59.22 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  60.15 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  57.48 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 594 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  58.73 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  55.43 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 595 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.9 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.03 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.9 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  56.08 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  56.47 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.48 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.04 
 
 		 592 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.22 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.9 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 		 598 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.9 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  57.25 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.16 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.29 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  56.42 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 		 251 aa  284  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.51 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  57.98 
 
 		 267 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  55.86 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.92 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.59 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.69 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  56.64 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  55 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.84 
 
 		 595 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.06 
 
 		 619 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  50.2 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.72 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  56.08 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.33 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.14 
 
 		 256 aa  282  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.29 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  57.65 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.64 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 		 253 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.27 
 
 		 581 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  53.44 
 
 		 247 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  56.42 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.89 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>