More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3538 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  45.25 
 
 
287 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  43.89 
 
 
296 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  40.56 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40.91 
 
 
274 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  43.51 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  43.21 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.37 
 
 
275 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.49 
 
 
279 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  41.6 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  38.31 
 
 
282 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  39.16 
 
 
278 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  34.74 
 
 
273 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  33.56 
 
 
274 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 
275 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  34.26 
 
 
274 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  33.56 
 
 
274 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  35.51 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  33.22 
 
 
278 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  32.82 
 
 
269 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  30.99 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  36.29 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  34.63 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  35.52 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  30.79 
 
 
334 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  31.56 
 
 
265 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 
338 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  35.52 
 
 
259 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  35.52 
 
 
269 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
266 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  30.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  34.75 
 
 
276 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  34.36 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.98 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  33.22 
 
 
266 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  31.7 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  31.83 
 
 
268 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  29.47 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  29.47 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  32.32 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  32.49 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  28.84 
 
 
335 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  29.69 
 
 
318 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  30.45 
 
 
273 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 
266 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  30.68 
 
 
264 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  33.21 
 
 
263 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  32.2 
 
 
273 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  29.67 
 
 
267 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
331 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  29.92 
 
 
273 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  30.07 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  30.85 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  26.47 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  27.64 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  26.44 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  31.34 
 
 
292 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  26.12 
 
 
316 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  28.84 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  25.72 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  27.52 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  30.04 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  26.57 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  24.26 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  26.33 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.1 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  24.3 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  28.27 
 
 
1078 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  25.85 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  29.48 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  25.94 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  25.94 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  25.94 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  25.08 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  24.26 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  26.47 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  24.23 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  26.57 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  26.86 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  26.48 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  26.48 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  25.46 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  26.48 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>