More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2194 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  59 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  51.84 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  49.5 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  47.83 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  48.49 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  46.84 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.72 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  41.33 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  44.64 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 295 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  42.19 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  44.6 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  44.85 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 300 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 315 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  40.48 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  37.76 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1107  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1746  HTH-type transcriptional regulator  40.49 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1470  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.644584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0771  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0576  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.268348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  38.26 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>