142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4944 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4944  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  84.33 
 
 		 809 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  65.67 
 
 		 818 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  64.54 
 
 		 781 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  65.47 
 
 		 822 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.69 
 
 		 825 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  61.94 
 
 		 814 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  60.45 
 
 		 793 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  61.19 
 
 		 826 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.45 
 
 		 816 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  56.93 
 
 		 788 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  51.75 
 
 		 848 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  51.39 
 
 		 846 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  51.39 
 
 		 787 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  51.39 
 
 		 787 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  51.39 
 
 		 787 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  48.95 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  48.25 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  47.55 
 
 		 787 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 840 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  50 
 
 		 787 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50 
 
 		 783 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  45.03 
 
 		 786 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  48.92 
 
 		 783 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  44.83 
 
 		 787 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  48.61 
 
 		 790 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  42.48 
 
 		 829 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  43.15 
 
 		 786 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.15 
 
 		 786 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  44.06 
 
 		 786 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  42.36 
 
 		 787 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  42.57 
 
 		 788 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  40.6 
 
 		 744 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.97 
 
 		 713 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 743 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.82 
 
 		 731 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  39.85 
 
 		 735 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.69 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  36.3 
 
 		 730 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  32.84 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  31.58 
 
 		 721 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  30.86 
 
 		 741 aa  63.5  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  32.84 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  34.07 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.55 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  31.34 
 
 		 727 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  32.09 
 
 		 728 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  30.3 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  32.09 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.64 
 
 		 837 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 726 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  29.41 
 
 		 724 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  28.79 
 
 		 724 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  27.94 
 
 		 723 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.58 
 
 		 739 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 723 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.88 
 
 		 830 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 737 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  27.54 
 
 		 721 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  29.63 
 
 		 723 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  28.36 
 
 		 728 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  28.36 
 
 		 728 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  28.36 
 
 		 728 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  29.32 
 
 		 729 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 728 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  24.63 
 
 		 724 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  26.09 
 
 		 721 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  29.85 
 
 		 709 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  29.85 
 
 		 709 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  28.79 
 
 		 723 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  51.52 
 
 		 119 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  30.6 
 
 		 726 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.09 
 
 		 721 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  28.99 
 
 		 722 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  27.54 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  27.54 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  27.41 
 
 		 723 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  27.41 
 
 		 720 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  27.54 
 
 		 722 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  27.54 
 
 		 722 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  29.1 
 
 		 727 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  37.8 
 
 		 849 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 		 727 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.48 
 
 		 795 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>