More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4541 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  61.21 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  66.55 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  65.76 
 
 		 335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  53.53 
 
 		 325 aa  342  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  47.53 
 
 		 325 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  46.78 
 
 		 334 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  40.75 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.11 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.82 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.82 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  34.78 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  33.68 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.2 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  32.72 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  35.84 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.65 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.03 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  31.23 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.9 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  32.32 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  35.31 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  35.26 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  35.1 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  38.1 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  35.86 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  30.65 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.4 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.91 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.44 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  32.06 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.48 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  31.29 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  32.43 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  37.15 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  34.71 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  30.87 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  30.56 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  34.25 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  32.73 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  33.01 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.38 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.42 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  33.75 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.92 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.33 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  34.18 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.42 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  29.34 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.32 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  31.4 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  31.21 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  31.33 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  31.51 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  30.94 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  32.92 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.12 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  33.67 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  30.25 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  36.46 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  31.74 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  33.67 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  31.89 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  32.67 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  33.11 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  33.11 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  31.08 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  34.07 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  35.11 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  33.11 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.28 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.86 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.99 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  32.57 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  34.05 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  31.38 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  33.13 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  32.89 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  31 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  32.57 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.21 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  33.45 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  34.08 
 
 		 327 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>