More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4455 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  90.44 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  87.2 
 
 		 251 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  88.45 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  88.05 
 
 		 251 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  80.08 
 
 		 251 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  78.49 
 
 		 251 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  80.4 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  76.89 
 
 		 256 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  74.8 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  73.9 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  73.09 
 
 		 262 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  76.49 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  68.53 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  69.72 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  72.8 
 
 		 262 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  68.92 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  66.8 
 
 		 259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  75.6 
 
 		 251 aa  349  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  70 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 262 aa  348  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  67.2 
 
 		 254 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  68.13 
 
 		 251 aa  344  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  68.53 
 
 		 251 aa  344  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  65.74 
 
 		 251 aa  344  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 271 aa  341  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  74.5 
 
 		 273 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  65.6 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  55.42 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  64.54 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 268 aa  284  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 268 aa  284  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  47.18 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  43.32 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  42.11 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  43.08 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  44.22 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  41.6 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 253 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  43.5 
 
 		 302 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.52 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  40.49 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  43.58 
 
 		 290 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 271 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  40.49 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  37.85 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  33.2 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  37.2 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.78 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  38.37 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  41.53 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  36.25 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>