More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1032 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  50.25 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.68 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.27 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
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NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
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NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 371 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.2 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32500  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275577  normal  0.254114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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