More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0329 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0329  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  76.79 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2553  ABC transporter related  76.39 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2063  ABC transporter related  78.07 
 
 		 241 aa  362  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.773711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4884  ABC transporter related  64.44 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4206  ABC transporter related  64.44 
 
 		 240 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1984  ABC transporter related  64.02 
 
 		 249 aa  310  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1372  ABC transporter related  64.44 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4058  ABC transporter related  63.18 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7684  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1933  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1803  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1794  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.32694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1751  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.612214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2033  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0482987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1934  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3409  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1969  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000310973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2012  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1768  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  47.3 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  45.99 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  45.57 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4106  ABC transporter related  45.8 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  43.83 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  45.19 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  45.19 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  46.03 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  43.57 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  43.57 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  44.26 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.95 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  41.95 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  41.81 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  42.8 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  41.6 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.4 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  39.74 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  44.3 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.58 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.26 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  48.7 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  45.15 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.1 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  42.37 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  42.55 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  44.96 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.12 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  43.22 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  41.53 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  40.17 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  43.28 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  42.98 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  42.26 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  41.53 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.1 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  43.33 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  38.52 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  40.59 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  42.98 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  41.77 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  41.42 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2175  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.549091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  40.93 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0076  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  45.04 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  43.88 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  42.37 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  43.88 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.92 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  41.82 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  42.98 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  40.85 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  44.44 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  41.35 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.56 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  40.93 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  41 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  40.93 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  37.18 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  42.62 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>