More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6285 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 
358 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  70.25 
 
 
355 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  58.21 
 
 
348 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  57.18 
 
 
344 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  56.89 
 
 
344 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  54.91 
 
 
353 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  52.81 
 
 
378 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.06 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.2 
 
 
351 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.43 
 
 
345 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.11 
 
 
346 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.83 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.83 
 
 
346 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.54 
 
 
346 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.54 
 
 
346 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.54 
 
 
346 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.83 
 
 
356 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  38.01 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 
355 aa  203  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.9 
 
 
349 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.72 
 
 
362 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.03 
 
 
367 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
165 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1324  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.65 
 
 
311 aa  92.8  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
171 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
251 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
171 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.98 
 
 
137 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  40 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
662 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
135 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
249 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
162 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  39.13 
 
 
158 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  39.13 
 
 
158 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  39.13 
 
 
158 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
151 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
320 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
186 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
165 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
229 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
212 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
226 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
260 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
162 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
151 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  29.55 
 
 
144 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
240 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
167 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
167 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
248 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
139 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
152 aa  59.7  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2823  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.55 
 
 
172 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
267 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
154 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0861  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.35 
 
 
172 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2915  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.02 
 
 
174 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36 
 
 
231 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
233 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
137 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
146 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
153 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
238 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
134 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  33.1 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0606  NUDIX hydrolase  25 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  0.376937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
144 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  37.39 
 
 
163 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1582  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.55 
 
 
168 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
147 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1037  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33 
 
 
176 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
228 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  35.64 
 
 
224 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
166 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
221 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.21 
 
 
139 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
155 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
136 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>