More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5584 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  65.95 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  65.25 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  60.38 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  59.74 
 
 		 349 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  59.18 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  57.1 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  55.45 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  50.3 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  50.3 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  51.5 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  53.77 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  51.27 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  48.42 
 
 		 333 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  48.84 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  49.09 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.53 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  48.79 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  48.03 
 
 		 332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  47.24 
 
 		 325 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.04 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  47.44 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  48.7 
 
 		 335 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  44.79 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  46.01 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.56 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.08 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.73 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  48.57 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  45.67 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.01 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.2 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.57 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.95 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.64 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.51 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  46.91 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.3 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.39 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.32 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.31 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.09 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.61 
 
 		 353 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  47.65 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.9 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.03 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  48.7 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.97 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.31 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.58 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.76 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.03 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.34 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  43.33 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.77 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.18 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.3 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.3 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.85 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.03 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.9 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  45.28 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  47.14 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  44.15 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.59 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.95 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.51 
 
 		 327 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.44 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.15 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.09 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.44 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.41 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.55 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.64 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  44.26 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.78 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  43.96 
 
 		 326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.54 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  44.3 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  45.3 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  46.43 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.96 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.37 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.99 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  48.34 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.82 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.62 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  43.71 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>