173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3862 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  83.37 
 
 		 451 aa  737    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 435 aa  899    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  85.19 
 
 		 439 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  45.79 
 
 		 465 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  45.1 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  47.27 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  52.47 
 
 		 520 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  52.47 
 
 		 520 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  49.27 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  50.16 
 
 		 512 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  37.95 
 
 		 546 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  37.33 
 
 		 548 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  43.86 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  41.2 
 
 		 512 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  33.15 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  33.21 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  32.85 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  34.19 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  33.7 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  33.46 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  32.12 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  31.31 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  28.37 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.82 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  42.86 
 
 		 961 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.06 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  29.89 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.07 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.82 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.65 
 
 		 2413 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.89 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1402 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.58 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.76 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  29.73 
 
 		 985 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  35.48 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.31 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  30.27 
 
 		 1200 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  30.27 
 
 		 1200 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1493 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1877 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.65 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.23 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.93 
 
 		 278 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1037 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.25 
 
 		 831 aa  56.6  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  31.28 
 
 		 213 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.89 
 
 		 680 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 209 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.34 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.17 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  36.27 
 
 		 212 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.69 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.48 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  36.73 
 
 		 303 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  32.54 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.78 
 
 		 557 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1281 aa  53.5  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.71 
 
 		 241 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  38.95 
 
 		 679 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.76 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.54 
 
 		 865 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.22 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  29.29 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1032 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  28.34 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 1430 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.65 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  34.21 
 
 		 315 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38 
 
 		 316 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  34.69 
 
 		 190 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 1110 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 190 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 		 798 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 1261 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  22.54 
 
 		 209 aa  50.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 		 254 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36 
 
 		 489 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.07 
 
 		 838 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  35.96 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 976 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  29.32 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  35.79 
 
 		 218 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 252 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  31.2 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.32 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>