63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0227 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  58.97 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  60 
 
 		 312 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  49.11 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  49.2 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.87 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  57.2 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  52.67 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  44.25 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  48.13 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  36.82 
 
 		 333 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  33.67 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  32.78 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  32.78 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  32.78 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  32.78 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  33.11 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  32.78 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.12 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  35.81 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  34.38 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  33.11 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  34.67 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.21 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  33.11 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  35.18 
 
 		 825 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  28.21 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  32.77 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  32.77 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  31.34 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  32.97 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  32.18 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  28.51 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  27.44 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.81 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  31.3 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  30.28 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  37.62 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  32.71 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4258  transporter DMT superfamily protein  34.04 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.06 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  31.78 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1861  transporter DMT superfamily protein  32.98 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  31.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  31.48 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1110  transporter DMT superfamily protein  29.38 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  33.77 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.71 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>