97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03496 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  42.99 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  44.56 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  42.93 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  41.71 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  41.9 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  43.59 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  41.03 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  40.09 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  39.8 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  38.89 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  39.06 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  39.39 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  35.64 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  38.12 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  37.5 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  37.5 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  33.16 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  36.26 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  36.14 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  39.31 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  34.76 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  34.76 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  35.17 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  33.13 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  34.15 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  35.17 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  37.5 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  34.62 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  35.57 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  34.01 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  31.4 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  31.4 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  32.88 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  33.74 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  34.19 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  32.5 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  29.1 
 
 		 1675 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.97 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  28.15 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  26.57 
 
 		 715 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.47 
 
 		 748 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  28.68 
 
 		 738 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.92 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  27.48 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  26.92 
 
 		 1018 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.21 
 
 		 1018 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.87 
 
 		 721 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  28.68 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.15 
 
 		 1018 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  30.83 
 
 		 732 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  28.82 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  32.94 
 
 		 725 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  26.56 
 
 		 722 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  24.63 
 
 		 906 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.43 
 
 		 734 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  24.63 
 
 		 906 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.92 
 
 		 1040 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.14 
 
 		 727 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  28.68 
 
 		 731 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  24.82 
 
 		 736 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25.17 
 
 		 714 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  26.36 
 
 		 695 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  25 
 
 		 721 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  24.44 
 
 		 1011 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  25.69 
 
 		 1717 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  28.93 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  24.82 
 
 		 908 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  22.73 
 
 		 726 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  23.41 
 
 		 724 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  32.84 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.83 
 
 		 759 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  26.21 
 
 		 727 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  25.93 
 
 		 731 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.38 
 
 		 760 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  19.4 
 
 		 656 aa  45.4  0.0007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf637  bacteriocin exporter and processing endoprotease C39  22.79 
 
 		 675 aa  45.4  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.66238  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  23.53 
 
 		 701 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.45 
 
 		 722 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.76 
 
 		 725 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  25.81 
 
 		 728 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  29.21 
 
 		 721 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.28 
 
 		 734 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.28 
 
 		 734 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.66 
 
 		 738 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  24.8 
 
 		 699 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.44 
 
 		 908 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  24.39 
 
 		 719 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  25 
 
 		 521 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.73 
 
 		 1013 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  23.74 
 
 		 743 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  30.93 
 
 		 747 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  24.43 
 
 		 1038 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  23.58 
 
 		 719 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.31 
 
 		 1019 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  25.52 
 
 		 695 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.67 
 
 		 721 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>