More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02232 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  85.61 
 
 
272 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  55 
 
 
275 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.99 
 
 
209 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  43 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.4 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
360 aa  82  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.89 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.96 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.22 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.24 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 
175 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.39 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.58 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  41.67 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
1026 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.25 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  41.67 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  41.67 
 
 
173 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.89 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 
454 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.04 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.67 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  28.72 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.62 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  39.58 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.11 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.38 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.03 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.38 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.38 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.62 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.11 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.32 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.11 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  29.53 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  29.53 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 
673 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.11 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.27 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.09 
 
 
623 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  31.45 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  33.87 
 
 
457 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  31.58 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.08 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.62 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.11 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 
333 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.51 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.45 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  33.9 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  34.26 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.29 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.58 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  31.5 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.19 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.04 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.59 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.18 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.18 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.19 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.65 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  29.09 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  32.79 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  37.17 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>