289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00760 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  62.5 
 
 		 289 aa  348  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  63.6 
 
 		 297 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  42.14 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  44.04 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  36.92 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  35.94 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  37.41 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  37.41 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  43.5 
 
 		 215 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  33.57 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  34.78 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  34.42 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  34.67 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  33.7 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  33.7 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  34.32 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  34.32 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  32.97 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  34.63 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  35.48 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  35.36 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  30.82 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  32.27 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  32.62 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  31.56 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  32.39 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  31.1 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  32.04 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  32.04 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.68 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  27.82 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.12 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.56 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.06 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.09 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.98 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.87 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.45 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.04 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.34 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  31.72 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.35 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.99 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.86 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.48 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  25.52 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  25.52 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  31.34 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.25 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  27.4 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.93 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.19 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.37 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.32 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  29.23 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.34 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  26.97 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  32.65 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.24 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  29.84 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.85 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.46 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  28.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.61 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  30.89 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.35 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  27.54 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  29.5 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  30.81 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.39 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  25.75 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.1 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.1 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.74 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.61 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  27.21 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  29.03 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  24.56 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>