214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1027 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  34.17 
 
 
203 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.52 
 
 
484 aa  94.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  34.09 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  40.28 
 
 
192 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  36.05 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0427  phospholipase D/transphosphatidylase  38.57 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  32.17 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  37.68 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  36.42 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.17 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.76 
 
 
376 aa  62  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  28.89 
 
 
223 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.29 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
223 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  27.94 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  27.01 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.95 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  25.71 
 
 
482 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 
393 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  26.9 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.41 
 
 
349 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.07 
 
 
363 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  27.13 
 
 
404 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.16 
 
 
577 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2838  phospholipase D/transphosphatidylase  31.71 
 
 
419 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.02 
 
 
229 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  28.12 
 
 
392 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.46 
 
 
366 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  29.31 
 
 
410 aa  54.3  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  28.89 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  29.93 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  28.89 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  28.33 
 
 
439 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  23.68 
 
 
479 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 
355 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  25.42 
 
 
422 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  27.78 
 
 
413 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 
420 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0278  phospholipase D family protein  28.32 
 
 
366 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0455  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.32 
 
 
389 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.45 
 
 
386 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.55 
 
 
534 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  28.85 
 
 
547 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 
489 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  26.09 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  26.32 
 
 
462 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  26.51 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  29.85 
 
 
529 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.67 
 
 
545 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.46 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18330  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  27.66 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  26.29 
 
 
537 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 
555 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2831  hypothetical protein  26.32 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000246961  decreased coverage  0.0000127532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  26.67 
 
 
545 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.29 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3452  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.94 
 
 
417 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.79 
 
 
474 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  31.68 
 
 
514 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  29.01 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 
485 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  29.17 
 
 
424 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  25.32 
 
 
472 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.84 
 
 
395 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 
397 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  28.75 
 
 
589 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  29.17 
 
 
424 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.84 
 
 
395 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3516  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.94 
 
 
417 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2320  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 
241 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 
417 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.03 
 
 
478 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  27.61 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  27.54 
 
 
219 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.79 
 
 
374 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  25.53 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  25.53 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0862  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 
370 aa  47.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  31.11 
 
 
481 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  28.68 
 
 
406 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 
424 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  29.01 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  29.77 
 
 
412 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3370  phospholipase D/transphosphatidylase  28.74 
 
 
410 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  29.81 
 
 
487 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  29.01 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 
528 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.19 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.19 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0887  phospholipase D/transphosphatidylase  28.68 
 
 
426 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.19 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>