More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0538 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  36.81 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  33.33 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1290  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.382555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  55.93 
 
 		 465 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.95 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  34.45 
 
 		 463 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  31.03 
 
 		 456 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  32.14 
 
 		 464 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  31.9 
 
 		 464 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 83 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  31.25 
 
 		 464 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  27.48 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  31.9 
 
 		 464 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  30.17 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  27.74 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  30.17 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  47.92 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  30.17 
 
 		 464 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  53.06 
 
 		 91 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  47.06 
 
 		 106 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 103 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  54 
 
 		 513 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  31.88 
 
 		 391 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.98 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.46 
 
 		 453 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  32.79 
 
 		 313 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 528 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 806 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  30.51 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 81 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0949  hypothetical protein  30.09 
 
 		 453 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000990304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.23 
 
 		 426 aa  48.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  30.71 
 
 		 462 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 93 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  30.25 
 
 		 454 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  35.48 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  46.3 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  37.29 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  30 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  28.45 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.57 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  30.28 
 
 		 368 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  37.29 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.06 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4802  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  35.71 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476342  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  31.36 
 
 		 457 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 124 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.87 
 
 		 845 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>