More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0259 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  53.64 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  53.64 
 
 		 153 aa  166  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  54.05 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  54.05 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  49.34 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  52.41 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  57.43 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  48.28 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  51.03 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  48.97 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  45.89 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  46.98 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  45.52 
 
 		 194 aa  127  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  41.1 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  54.11 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  39.74 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  41.26 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  40.52 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  38.97 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  42.36 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  41.96 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  36.57 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  37.32 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.57 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  34.33 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  37.41 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  36.99 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  35.86 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  36.99 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  37.4 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  36.55 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  37.88 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  35.86 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  32.88 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  35.11 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  37.12 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  37.4 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  35.11 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  34.48 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  35.11 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  34.85 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  33.56 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  30.34 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>