More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2907 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  100 
 
 		 442 aa  860    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  61.68 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  58.09 
 
 		 477 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  59.26 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  54.29 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  54.99 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1301  ammonium transporter  53.66 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500264  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  53.09 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  57.75 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  52.79 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  53.38 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  51.98 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  52.06 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  51.24 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5508  ammonium transporter  53.21 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3518  ammonium transporter  52.94 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0107825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4891  ammonium transporter  53.92 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4980  ammonium transporter  53.92 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  50 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5259  ammonium transporter  53.92 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  49.55 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  51.4 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  52.2 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  49.55 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  50.47 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  49.55 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  50.58 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  50.71 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  50.12 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  49.66 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  50.23 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.41 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  54.31 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  49.55 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  46.22 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  49.3 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  49.29 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  53.15 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  48.1 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  51.05 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  48.36 
 
 		 451 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  48.58 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  46.45 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  48.72 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.35 
 
 		 449 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  49.43 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  47.92 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.22 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  46.28 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.82 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  45.98 
 
 		 488 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  46.62 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  46.01 
 
 		 489 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  43.97 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.98 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  45.41 
 
 		 485 aa  319  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.1 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.98 
 
 		 515 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  45.63 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  46.7 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  45.71 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  43.25 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  46.12 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  44 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  44.24 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  43.76 
 
 		 411 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  44 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  44.06 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  45.16 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  43.76 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  43.76 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.22 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  41.63 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  43.76 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  44.47 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  44.71 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  43.53 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2710  ammonium transporter  44.07 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  47.29 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4808  ammonium transporter  43.9 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  48.81 
 
 		 420 aa  304  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.35 
 
 		 406 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  42.89 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.5 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.26 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2057  ammonium transporter  43.88 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  43.76 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.16 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  42.79 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  45.52 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  45.26 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  42.92 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  45.5 
 
 		 411 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.88 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  44.16 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  44.16 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  43.06 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  44.42 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.96 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  41.96 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>