More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1953 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 126 aa  237  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  51.19 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  53.16 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3545  regulatory protein ArsR  52.59 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  44.04 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  47.95 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  49.4 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  52.38 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  53.01 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  42.68 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  46.91 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4975  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.87 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  45.65 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  43.48 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  36.59 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>