136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1657 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  57.86 
 
 
174 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  48.45 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  48.45 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  48.45 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  48.08 
 
 
249 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  51.85 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  52.59 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  50.68 
 
 
164 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.31 
 
 
219 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  50 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  53.19 
 
 
175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  44.7 
 
 
331 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  47.77 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  48.61 
 
 
191 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  45.27 
 
 
173 aa  104  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  46.98 
 
 
269 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  48.15 
 
 
211 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  46.88 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  46.03 
 
 
291 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  47.01 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  46.96 
 
 
223 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  50 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  36.36 
 
 
195 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  39.86 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  42.86 
 
 
362 aa  82  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  45.93 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.35 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.86 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  44.76 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  43.88 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  32.81 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  30.99 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  35.11 
 
 
373 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.46 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  36.67 
 
 
409 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  33.07 
 
 
445 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  27.78 
 
 
491 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  38.36 
 
 
389 aa  47.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  29.63 
 
 
345 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  32.71 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  30.91 
 
 
383 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  37.36 
 
 
306 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.36 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  28.57 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.36 
 
 
319 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.18 
 
 
498 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.97 
 
 
293 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  32.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.61 
 
 
318 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  28.78 
 
 
598 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  29.25 
 
 
450 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  29.63 
 
 
404 aa  44.7  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.23 
 
 
387 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  29.09 
 
 
386 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.09 
 
 
386 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  29.09 
 
 
386 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  30 
 
 
384 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  38.96 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0355  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.62 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.212949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  25 
 
 
388 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  30 
 
 
384 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  28.75 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  31.58 
 
 
293 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  28.18 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  35.42 
 
 
509 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  27.4 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  28.89 
 
 
344 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  27.4 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  27.4 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  28.18 
 
 
384 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.09 
 
 
386 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  36.67 
 
 
274 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.83 
 
 
464 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  27.59 
 
 
447 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  33.33 
 
 
491 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.38 
 
 
283 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  29.09 
 
 
386 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  27.59 
 
 
447 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  28.68 
 
 
446 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  26.35 
 
 
374 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  29.23 
 
 
328 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  28.33 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  29.03 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  27.59 
 
 
250 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  28.18 
 
 
386 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.58 
 
 
321 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  29.37 
 
 
333 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  29.41 
 
 
290 aa  42.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  29.31 
 
 
379 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.48 
 
 
462 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  26.9 
 
 
250 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  26.47 
 
 
360 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.33 
 
 
472 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  29.46 
 
 
401 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  32.22 
 
 
468 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  32.22 
 
 
468 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  25.95 
 
 
327 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.22 
 
 
468 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  34.69 
 
 
283 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>