87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3860 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
112 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  65.56 
 
 
128 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  51.89 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  45.79 
 
 
113 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 
113 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  40.74 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  43.3 
 
 
106 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  39.45 
 
 
190 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  34.91 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  44.23 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  44.66 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  38.68 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.74 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  37.72 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  37.11 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  33.33 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  34.91 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  34.34 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  36.56 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  35.42 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  35.35 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  29.13 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  49.12 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  29.13 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  35.85 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  36.84 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  36.36 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  36.36 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 
106 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  41.54 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32.08 
 
 
107 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  36.49 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  36.92 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  37.74 
 
 
56 aa  52  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  31.48 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  39.22 
 
 
56 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  36 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  41.43 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  39.13 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  39.06 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  34.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  28.89 
 
 
122 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3797  hypothetical protein  31.96 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000000371687  hitchhiker  0.0000203227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  34.33 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  41.43 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  28.7 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  36.51 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  33.85 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  46.15 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0987  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.827224  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  43.14 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  37.04 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  40.91 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  33.82 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  39.22 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  36.21 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1463  hypothetical protein  28.26 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1136  hypothetical protein  35.8 
 
 
88 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  31.25 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  29.73 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  26.09 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  40.91 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  26.09 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  26.09 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7028  hypothetical protein  34.12 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  26.85 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  28.28 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  32.31 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  37.04 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  28.28 
 
 
116 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>