81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2563 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  226  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  226  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  99.07 
 
 
108 aa  224  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  64.15 
 
 
190 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  59.26 
 
 
110 aa  141  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  55.66 
 
 
107 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  54.63 
 
 
113 aa  133  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  53.77 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  54.63 
 
 
113 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  53.7 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  51.43 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  53.33 
 
 
116 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  52.43 
 
 
115 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  47.17 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  46.23 
 
 
113 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  45.28 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  72.88 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  40.57 
 
 
109 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  40.74 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  44.09 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  44.32 
 
 
88 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  43.48 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  42.72 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  43.16 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  43.16 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.86 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  69.39 
 
 
56 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  69.39 
 
 
56 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  41.49 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  36.45 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  38.74 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  37.62 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  49.3 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  37.25 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  37.25 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  37.04 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  35.87 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  36.63 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  36.45 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  46.27 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  27.78 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  27.78 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  34.55 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  36.99 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  26.85 
 
 
108 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  37.97 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  37.97 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  36.59 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  43.66 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  36.99 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  36.99 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  34.04 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  38.24 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  38.24 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  38.98 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  27.93 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  27.37 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  33.9 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  34.43 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  39.22 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  28.81 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4644  hypothetical protein  28.92 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.199743  normal  0.0327695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  34.48 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  25.53 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  31.03 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7028  hypothetical protein  31.76 
 
 
121 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>