60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4296 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  250  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  98.33 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  99.05 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  98.1 
 
 		 105 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  58.41 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  61.11 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  56.76 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  58.33 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  53.33 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  48.62 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  48.7 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  51.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  48.62 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  47.22 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  51.43 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  47.17 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  47.17 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  48.51 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  43.52 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  43.52 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  51.11 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  51.72 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  48.94 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  41.12 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  45.1 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  43.27 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  62.07 
 
 		 73 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  54.41 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  38.95 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.44 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  36.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  37.25 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  42.53 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  33.66 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  37.86 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.86 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  32.41 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.48 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  36.51 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  31.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  34.72 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  33.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  33.33 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  37.1 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  31.43 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  29.03 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.09 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  29.85 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  31.75 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  31.15 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>