55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4453 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
115 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  91.3 
 
 
124 aa  209  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  54.13 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  48.11 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  49.06 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  44.04 
 
 
111 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  44.74 
 
 
118 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  46.49 
 
 
116 aa  106  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  43.48 
 
 
134 aa  105  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  47.12 
 
 
119 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  40.71 
 
 
116 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  47.12 
 
 
119 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  43.81 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  43.81 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  43.81 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  34.91 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  34.29 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  45.07 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  44.44 
 
 
103 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  37.11 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  43.37 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  34.26 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  43.24 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  33.63 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  32.2 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  41.25 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  42.11 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  43.84 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  39.8 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  45.9 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  32.41 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  42.67 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  32.08 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  41.89 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  41.89 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  30.65 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  50.85 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  29.09 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  30.84 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  41.43 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  65.52 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  65.52 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  25.86 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  41.27 
 
 
107 aa  43.9  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.7 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3492  protein of unknown function DUF891  31.31 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.603175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  31.87 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  27.17 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>