41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4176 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  95.97 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  92.44 
 
 		 119 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  88.24 
 
 		 119 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  87.39 
 
 		 119 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  65.38 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  63.21 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  57.94 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  60.58 
 
 		 111 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  51.38 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  48.54 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  50.46 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  45.71 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  43.81 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  46.6 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  42.62 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  31.07 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  28.04 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  31.82 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  27.52 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  35 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  38.03 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  25 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  38.24 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  26.02 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  36.76 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.91 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  36.23 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  31.68 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  27.37 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  27.37 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  31.08 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.71 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  31.08 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>