73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0764 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  66.37 
 
 
119 aa  163  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  37.39 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  38.26 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  38.79 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  38.79 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  47.76 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  36.29 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  35.24 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  30.33 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  32.71 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  44.3 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  37.38 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  31.48 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  59.3  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  33.66 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  29.91 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  31.13 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  40.91 
 
 
115 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  40.24 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  57  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  43.75 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.45 
 
 
190 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  31.07 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  39.02 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  31.07 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  40.74 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  34.55 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  34.55 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  34.55 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  45.9 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  32.63 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  32.71 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  29.13 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  35.24 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  32.98 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  28.16 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  39.51 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  38.55 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4383  Protein of unknown function DUF2137  32.65 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  31.19 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  31.19 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  34.94 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32.43 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0913  hypothetical protein  31.68 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  41.57 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  41.57 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  30.28 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  30.28 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  28.71 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  35.71 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  34.04 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  34.38 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  30.99 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  31.52 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  28.12 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  27.78 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  31.34 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  27.27 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  32.99 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  28.38 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  37.23 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>