67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2242 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  73.33 
 
 
107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  51.89 
 
 
113 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  50.48 
 
 
116 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  49.52 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  48.08 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  49.52 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  51.43 
 
 
113 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  49.51 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  43.69 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  47.62 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  42.31 
 
 
190 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  44.76 
 
 
107 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  49.43 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  41.94 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  37.04 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  41.94 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  57.14 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  35.42 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  37.62 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  33.7 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  34.07 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  60.87 
 
 
56 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  33.01 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  56 
 
 
56 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  35.87 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  49.23 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  34.95 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  46.38 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  34.95 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  34.29 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  36.89 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  36.89 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  44.93 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  27.62 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  27.62 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  42.65 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  26.67 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  41.43 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  40.91 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  35.24 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3255  hypothetical protein  31.18 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725337  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  37.68 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  36.23 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  32.88 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  31.08 
 
 
118 aa  43.9  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  36.76 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  36.23 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  36.23 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  36.23 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  32.86 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  38.6 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  31.65 
 
 
119 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  35.85 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  38.1 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  35.09 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>