59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7033 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  248  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  54.46 
 
 
118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  54.13 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  56.76 
 
 
134 aa  130  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  51.38 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  53.27 
 
 
111 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  59.22 
 
 
111 aa  123  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  50.89 
 
 
118 aa  123  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  52.29 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
116 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  48.54 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  49.51 
 
 
119 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  49.51 
 
 
119 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  46.6 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  46.6 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  45.63 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  46.67 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  50 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  38.74 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  38.74 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  38.74 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  46.67 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  45.33 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  45.33 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  47.22 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  46.48 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  43.84 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  44.59 
 
 
190 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  46.38 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  41.89 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  44.29 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  44.29 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  45.76 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  26.87 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  41.43 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  45 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  35.24 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  31.31 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  33.02 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  50.98 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  50.98 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  38.81 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  32.41 
 
 
117 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  40.98 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  36.92 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  29.82 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  42.37 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  28.85 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  28.85 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  29.58 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  47.06 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  47.06 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  27.27 
 
 
119 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>