34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0649 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  99.15 
 
 
117 aa  236  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  67.52 
 
 
117 aa  166  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  58.04 
 
 
128 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  63.53 
 
 
101 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  40 
 
 
119 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  38.79 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  33.98 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  33.65 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  43.94 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  35.09 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1917  hypothetical protein  35.58 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0913  hypothetical protein  37 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  29.81 
 
 
118 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  29.81 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0589  hypothetical protein  48.78 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  30.1 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  31.73 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1385  hypothetical protein  46.3 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  32.35 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  35.38 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  38.6 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  28.85 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  27.37 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  27.37 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  42.59 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  40.35 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  27.37 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>