70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1723 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
108 aa  225  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  71.3 
 
 
113 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  61.11 
 
 
110 aa  150  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  60.95 
 
 
106 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  46.23 
 
 
190 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  47.62 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  43.81 
 
 
116 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  45.71 
 
 
107 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  41.51 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  40.95 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  42.59 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  37.04 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.38 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  42.27 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  41.24 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  50.85 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  40.23 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  39.81 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  31.73 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  35.35 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  34.65 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  38.04 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  38.04 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  31.13 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  44.44 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  44.44 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  57.14 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  57.14 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  43.66 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  42.25 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  31.58 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  33.66 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  33.66 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  33.66 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  32.67 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  42.11 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  38.03 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  42.65 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  40.79 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  46.3 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 
118 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  36.17 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  32 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  38.55 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  32.32 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  40.35 
 
 
128 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  33.78 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  34.43 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  38.6 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  27.84 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  26.32 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  31.08 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  32.79 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.15 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  30.61 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  24.76 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  24.76 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  32.2 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  29.73 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  35.38 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  31.67 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  36.21 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  35.71 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>