43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2426 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  257  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  44.74 
 
 
117 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  40.82 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  47.95 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  28.7 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  38.54 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  33.66 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  43.08 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  34.65 
 
 
107 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  45.76 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  44.07 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  38.81 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  46.55 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0913  hypothetical protein  34.04 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  40.35 
 
 
108 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  35.23 
 
 
95 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1385  hypothetical protein  45.65 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  44.44 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  30.95 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  38.6 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  43.75 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  48.15 
 
 
106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  41.67 
 
 
118 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  48.15 
 
 
106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  31.03 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  27.36 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1917  hypothetical protein  35.94 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  37.88 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  38.03 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1790  hypothetical protein  44.23 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.542832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  48 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  29.36 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  42.37 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8075  hypothetical protein  26.47 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.712439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  44.23 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>