50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0011 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  59.22 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  42.16 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  42.16 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  42.72 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  42.72 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  41.75 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  39 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  42.16 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  42.16 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  42.16 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  39.81 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  38.83 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  39.81 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  38.61 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  37.62 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  40.91 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  38.68 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  33.01 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  32.71 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  38.68 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  39.05 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  35.85 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  32.67 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  45.31 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  45.9 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  44.26 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  44.83 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.36 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  37.97 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  31.91 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  31.91 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  46.55 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  40.98 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  40 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  43.14 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  43.86 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  39.29 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  45.45 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  45.45 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  40.35 
 
 
117 aa  42  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  31.52 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  27.36 
 
 
114 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  40.35 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  32.98 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>