76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0038 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  98.04 
 
 
103 aa  205  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  43.69 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  42.72 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  47.06 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  41.75 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  41.75 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  43.3 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  44.33 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  42.16 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  44.09 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  45.16 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  44.09 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  44.09 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  44.66 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  42.27 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  42.11 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.71 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  39.13 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  39.13 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  38.71 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  40.66 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  40.66 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  40.86 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  34.07 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  40.66 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  33.65 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  33.65 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  35.23 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  33.68 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  49.12 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  45.07 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  36.46 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  40.24 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  38.14 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  44.29 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  42.25 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  53.19 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  53.19 
 
 
56 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  32.98 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  31.91 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  39.44 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  31.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  38.67 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  29.13 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  48 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  39.71 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  38.57 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  37.78 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  43.66 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  28.71 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  31.63 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  43.66 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  32.26 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  26.04 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  27.37 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  37.93 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  26.32 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  33.68 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  38.81 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1463  hypothetical protein  30.68 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  44.44 
 
 
72 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  36.62 
 
 
118 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  31.58 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  28.72 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  41.51 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  30.23 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>