85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4156 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  73.45 
 
 
113 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  54.21 
 
 
113 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  52.83 
 
 
190 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  43.81 
 
 
107 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  47.17 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  47.57 
 
 
116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  43.69 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  42.31 
 
 
106 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  45.79 
 
 
113 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  45.19 
 
 
110 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  40.57 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  41.35 
 
 
128 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  37.38 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  42.05 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  62.3 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  37.74 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  45.45 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  45.98 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  59.26 
 
 
56 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  59.62 
 
 
56 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  33.64 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  31.78 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  33.96 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  33.96 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  36.26 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  36.26 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  35.48 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  32.67 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32.32 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  41.89 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  38.16 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  32.76 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  33.71 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  39.8 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  25.42 
 
 
119 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  37.31 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  35.42 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  46.38 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  43.86 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  36.21 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  30 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  31.58 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  44.68 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  37.29 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  37.31 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  46.94 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  32.1 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  36.76 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  37.29 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  34.25 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  34.65 
 
 
111 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  37.7 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  37.5 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  37.5 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  29.47 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  26.97 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  36.21 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  35.59 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  38.6 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  37.1 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  38.98 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  35.59 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  39.19 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  33.82 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3255  hypothetical protein  29.35 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725337  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  33.82 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  37.7 
 
 
69 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>