75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1828 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  94.44 
 
 		 115 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  53.85 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  53.33 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  48.57 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  50.48 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  51.43 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  51.38 
 
 		 190 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  49.52 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  49.09 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  47.57 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  43.81 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  54.29 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  41 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  44.09 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  35.85 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  57.14 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  37.11 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  40.66 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  40.66 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  36.08 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  39.42 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  46.67 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  39.42 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  38.46 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  57.14 
 
 		 56 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  53.7 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  38.68 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  44.3 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  40.48 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  40.54 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  32.41 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  32.41 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  38.96 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  44.29 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  37.84 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  31.48 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  32.76 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  41.89 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  38.67 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  41.27 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  38.6 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  31.48 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  41.38 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  36.51 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  34.92 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  29.63 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  28.3 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  30.65 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  35.59 
 
 		 112 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  29.03 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  29.03 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  29.03 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  38.03 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>