63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5448 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  57.28 
 
 
128 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  51.89 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  43.81 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  42.06 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  52.13 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  40.19 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  36.19 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.14 
 
 
113 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  37.38 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  36.45 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  36.45 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  37.04 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.51 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  35.85 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  34.91 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  38.95 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  39.05 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  40.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  33.96 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  34.83 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  35.64 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  35.64 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  31.13 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  38.3 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  37.89 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  37.89 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  38.3 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  48.94 
 
 
56 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  48.94 
 
 
56 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  48.15 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  28.97 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  28.97 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  28.97 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  43.1 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  32.31 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  35.87 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1463  hypothetical protein  34.07 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  29.79 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  38.81 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  34.85 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  45.45 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  47.73 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  37.7 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  34.04 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  37.31 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  32.05 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  32.73 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  66.67 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  43.9 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  35.23 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  46.51 
 
 
112 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  35.19 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  60 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  43.9 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  44.19 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3492  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.603175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  44.19 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  31.31 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>