86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2788 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  100 
 
 		 113 aa  238  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  50 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  54.13 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  54.21 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  54.72 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  53.85 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  54 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  48.08 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  48.6 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  45.28 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  49.09 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  46.3 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  45.28 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  42.06 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  42.59 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  38.89 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  45.16 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  44.57 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  43.18 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  59.32 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.86 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  41.05 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  41.05 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1880  phage derived protein Gp49-like (DUF891)  55.56 
 
 		 56 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0310  hypothetical cytosolic protein  57.69 
 
 		 56 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  35.29 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  35.29 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  33.04 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  39.58 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  35.64 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  35.64 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  47.83 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  32.71 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  43.84 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0891  hypothetical protein  33.02 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3861  hypothetical protein  33.02 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.211652  hitchhiker  0.00940905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  44.93 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0946  hypothetical protein  32.08 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  31.71 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  35.37 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  39.73 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  41.79 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  43.28 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3723  hypothetical protein  29.47 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  45.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  42.67 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2819  protein of unknown function DUF891  46.94 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  36.92 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  37.33 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4063  hypothetical protein  38.03 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3583  hypothetical protein  38.03 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  32.22 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  38.03 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  38.03 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  38.03 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  38.03 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  36.23 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  36.21 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  31.75 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  35.38 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  39.19 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  33.8 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  30.14 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  31.88 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  33.82 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  27.36 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  32.35 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  36.92 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  31.75 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  31.75 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  31.75 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  30.99 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>