66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1038 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  73.21 
 
 
112 aa  174  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  70.27 
 
 
123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  69.37 
 
 
114 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  68.18 
 
 
113 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  67.92 
 
 
118 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  68.22 
 
 
112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  65.09 
 
 
117 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  65.09 
 
 
117 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  64.15 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  72.22 
 
 
107 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  60.95 
 
 
117 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  58.1 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  58.82 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  66.29 
 
 
103 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  51.46 
 
 
120 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  53.7 
 
 
114 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  51.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  54.84 
 
 
105 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  64.71 
 
 
91 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  54.84 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  51.89 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  48.65 
 
 
116 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  55.43 
 
 
102 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  40.38 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  39.42 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  59.38 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  39.81 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  40.57 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  35.05 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  38.46 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  35.14 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  37.38 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  42.53 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  35.19 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  40.4 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  35.58 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  29.52 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  34.43 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  36.21 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  36.84 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  36.51 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4346  hypothetical protein  53.06 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11309  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  38.1 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  35.09 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  40.74 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  26.32 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  31.75 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  28.57 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  27.37 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  39.66 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  37.88 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  37.74 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  31.67 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  28.38 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  32.31 
 
 
106 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>