44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4351 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  55.75 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  60.19 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  58.04 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  54.7 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  56.07 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  55.96 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  55.96 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  55.86 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  54.55 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  56.86 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  48.21 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  52.59 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  58.02 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  44.74 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  40.78 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  42.74 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  40.78 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  39.81 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  41.75 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  37.86 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  41.75 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  41.76 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  36.89 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  36.79 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  39.56 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  38.27 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  38.27 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  33.98 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  37.78 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  36.54 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  38.37 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  29.52 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  40.82 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  44.26 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  44.26 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>