44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3842 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  253  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  62.73 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  52.94 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  54.17 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  54.55 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  50.43 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  52.94 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  52.78 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  48.21 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  50.96 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  50.49 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  47.79 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  48.57 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  40.57 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  54.17 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  41.9 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  40.95 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  38.39 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  41.44 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  41.84 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  41.58 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  40.82 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  41.58 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  37 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  41.41 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  39.81 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  41.18 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  40.48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  36.11 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  42.86 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  36.19 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  35.19 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  40.43 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  37.31 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  41.86 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>