75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0025 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  235  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  71.96 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  71.3 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  67.86 
 
 		 113 aa  160  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  66.36 
 
 		 114 aa  156  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  68.22 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  62.86 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  63.21 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  63.46 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  62.26 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  64.04 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  60 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  60.95 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  74.42 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  53.33 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  55 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  55 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  54.9 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  52.38 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  64.44 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  51.96 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  61.36 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  53.33 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  54.29 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  56.25 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  58.21 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  38.53 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  70 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  38.39 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  39.82 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  38.68 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  40.38 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  36.75 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  32.65 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  36.89 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  39.56 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  40.3 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  32.71 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  32.71 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  37.33 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  28.71 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  35.24 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  34 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  28.71 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  39.66 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  37.68 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  38.46 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  37.31 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  37.04 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  38.75 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  34.92 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  41.38 
 
 		 106 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  46.51 
 
 		 108 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4346  hypothetical protein  44.12 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11309  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  36.21 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  36.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  31.34 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1559  hypothetical protein  55.26 
 
 		 75 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>